M2T? Spíš si myslím, že to je obyčejnej MPEG (nebo olej do dvoutaktů), ve kterým se vysílá, akorát to má jinou příponu. V čem to video nahráváš? Vynikající je linuxovej program Me TV, dobře může posloužit i VLC.
Na střih používám LiVES, ale spousta jiných videoeditorů tohle taky umí, třeba Kdenlive, Avidemux, Pitivi, snad by to mohl umět GopChop (funguje bezeztrátově).